الأعضاء التي تعمل لتحويل الغذاء إلى الطاقة والعناصر المغذية معروفة  باسم الجهاز الهضمي.  عند تناول الطعام، يتحرك الطعام الذي تناولته على طول القناة الهضمية.
تبدأ هذه القناة الهضمية مع تجويف الفم، وتستمر من خلال البلعوم والمريء والمعدة والأمعاء الصغيرة والكبيرة، وتنتهي بالمستقيم. أعراض الحساسية الهضمية تشمل: الألم اليومي في المعدة أو البطن والانتفاخ الشديد والإمساك، صعوبة البلع والقيء والشعور بالغثيان، حرقة من المعدة  وإسهال وتجفاف وحتى سوء التغذية.